Avalado por su autoridad, prestigio, honestidad y liderazgo inobjetable, Lázaro Peña González fue electo secretario general de la organización fundada en el aniversario 86 del natalicio de José Martí. En 1947, elementos corruptos y pandilleros encabezados por Eusebio Mujal Barniol socavaron la unidad de la clase obrera y con el apoyo del gobierno y del imperialismo estadounidense implantaron por la fuerza una etapa caracterizada por el asalto a los sindicatos, la imposición de falsos dirigentes y la persecución, tortura y asesinato de verdaderos representantes de las masas. La CTC pasó a manos del pueblo trabajador con el triunfo de la Revolución cubana, en enero de 1959.